תכונות האתרים מחולקות לתכונות פיזיקליות וכימיות. בסך הכל, התכונות הכימיות שלהם יציבות יחסית, כמפורט להלן:
מאפיינים פיזיים
מצב וריח: בטמפרטורת החדר, רק דימתיל אתר ומתיל אתיל הם גזים; רוב האתרים הם נוזלים חסרי צבע עם ריח אופייני.
נקודות התכה ורתיחה: מכיוון שמולקולות האתר אינן יכולות ליצור קשרי מימן, נקודות הרתיחה שלהן נמוכות בהרבה מאלכוהולים בעלי אותו מספר של אטומי פחמן, וקרובות לאלו של אלקנים בעלי משקל מולקולרי דומה.
מסיסות: מסיס בקלות בממיסים אורגניים. לאתרים נמוכים יותר יש מסיסות מסוימת במים, בעוד שאתרים גבוהים יותר מסיסים במשורה. אתרים מחזוריים כגון טטרהידרופורן ו-1,4-דיוקסאן, עקב אטומי חמצן חשופים, יכולים ליצור קשרי מימן עם מים והם ניתנים לערבב לחלוטין עם מים.
צפיפות: לרוב האתרים יש צפיפות פחותה ממים והם נוזלים דליקים; האדים שלהם יכולים ליצור תערובות נפיצות עם אוויר.
מאפיינים כימיים
אתרים (למעט אתרים מחזוריים) הם בדרך כלל אינרטיים מבחינה כימית, עם יציבות נמוכה מעט מאלקנים. הם יציבים למתכות אלקליות, בסיסים חזקים, חומרי חמצון וחומרים מפחיתים. הם אינם מגיבים עם נתרן מתכתי בטמפרטורת החדר, לכן נתרן מתכתי משמש לעתים קרובות לייבוש אתרים, מה שהופך אותם למתאימים כממיסים אורגניים.
התגובות האופייניות שלהם כוללות בעיקר:
יצירת מלחי גנאט: לאטום החמצן בקשר האתר יש זוג בודד של אלקטרונים, שיכול לשמש כבסיס חלש לשילוב עם חומצות חזקות מרוכזות (כגון חומצה גופרתית מרוכזת וחומצה הידרוכלורית מרוכזת) ליצירת מלחי גנאט, ובכך להתמוסס בחומצות חזקות מרוכזות. ניתן להשתמש בתכונה זו כדי להפריד ולזהות אתרים מאלקנים/הלואלקנים; זה יכול גם להגיב עם חומצות לואיס כגון בורון טריפלואוריד, אלומיניום טריכלוריד וריאגנטים של Grignard כדי ליצור מלחי גנאט.
ביקוע קשרי אתר: בתנאי חימום, אתרים יכולים להגיב עם חומצות הידרותליות, לשבור את קשר האתר ליצירת אלכוהול והלואלקן; אם החומצה ההידרופלית נמצאת בעודף, האלכוהול שנוצר ימשיך להגיב כדי לתת שתי מולקולות של הלואלקן. התגובה היא בדרך כלל HI > HBr > HCl.
חימצון-אוטומטי: אתרים כגון דיאתיל אתר, בחשיפה ממושכת לאוויר ואור, ייצרו פרוקסידים נפיצים לא-נדיפים. שאריות פרוקסידים במהלך הזיקוק עלולות לעורר פיצוץ. לפני השימוש באתרים המאוחסנים לתקופות ממושכות, יש לבדוק את רמות החמצן; אם מתגלה תוצאה חיובית, יש לטפל באתר לפני השימוש.
מאפיינים מיוחדים של אתרים מחזוריים: אתרים מחזוריים (כגון אפוקסידים) מציגים מתח טבעת, מה שהופך אותם ליותר תגובתיים מבחינה כימית. הם יכולים לעבור-תגובות פתיחת טבעות תחת קטליזה של חומצה או בסיס ולהגיב עם מגוון נוקלאופילים.